Les sectes sont souvent confondues avec les confréries d'initiation secrètes. Cependant, ils diffèrent dans leur organisation. Les fraternités d'initiation secrètes organisées traditionnellement sont assez flexibles. Leur leadership est soit collectif, soit individuel. Leader (chef, prêtre, etc.) cependant, il est choisi par l'organisation. S'il s'était choisi à l'élection, il pourrait être privé de son pouvoir et remplacé par quelqu'un d'autre. également, chaque membre de la fraternité participe au plan d'ensemble. Il n'est pas manipulé, il n'y a pas de manipulateur: il n'y a pas de manipulation.
Pendant ce temps, deux cas de graduel sont connus aujourd'hui, transformation drastique, ce qui peut se passer dans les mouvements d'initiation. Le premier exemple concerne une loge maçonnique – Propagande deux (P2) – qui a été enregistré dans les archives judiciaires dans les années 1980 et dont les dirigeants cherchaient plus à créer un réseau de mafia et d'influence politique qu'au développement spirituel du groupe. Le deuxième exemple concerne l'Ordre du Temple du Soleil., où l'enseignement criminel a progressivement remplacé les idées chevaleresques et initiatiques, formulé lors de la formation du groupe.